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Antibiotics | pen-level sample testing对牛呼吸道疾病治疗抗菌药物选择的影响

Antibiotics | pen-level sample testing对牛呼吸道疾病治疗抗菌药物选择的影响
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该研究使用混合ABM-DES模型,探讨不同pen-level采样和AMR检测策略对加拿大西部feedlot中BRD治疗相关抗菌药物使用和耐药性管理的影响,为未来AMR风险干预实验提供方法支持。

 

文献概述
本文《The Potential for Sample Testing at the Pen Level to Inform Prudent Antimicrobial Selection for Bovine Respiratory Disease Treatment: Investigations Using a Feedlot Simulation Tool》,发表于Antibiotics杂志,回顾并总结了pen-level采样与实验室检测对bovine respiratory disease(BRD)治疗中抗菌药物选择的影响,以及不同采样时间与检测方法对AMR流行率和经济结果的作用。文章通过模拟实验分析,强调了采样与检测策略在抗菌药物管理中的潜在价值,同时指出其效果受多种因素影响,如检测准确性、AMR流行率和治疗切换阈值等。

背景知识
抗菌药物耐药性(AMR)是全球公共卫生和畜牧业管理的重大威胁,主要由抗菌药物滥用和过度使用引起。牛呼吸道疾病(BRD)是北美feedlot中最常见的疾病,也是抗菌药物使用的主要原因。当前BRD治疗策略多基于临床症状,而非实验室检测,导致耐药性病原体传播和治疗失败风险。研究团队此前开发了混合agent-based和discrete-event simulation(ABM-DES)模型,以模拟AMR在高风险牛群中的动态,并探索不同采样策略对抗菌药物管理的影响。本研究旨在验证pen-level采样和检测是否能优化抗菌药物选择,减少耐药性发展,同时评估其在不同条件下的适用性,为未来的AMR控制策略提供理论支持。

 

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研究方法与实验
研究基于之前开发的随机、连续时间ABM模型,并将其扩展为混合ABM-DES模型,以模拟pen-level采样和检测流程。模型包含一个Testing agent,用于模拟采样、运输、处理和检测的时间延迟。采样时间点包括feedlot arrival(0 DOF)和13 days on feed(DOF),检测方法包括antimimicrobial susceptibility testing(AST)和long-read metagenomic sequencing(MS)。模型还设定了25%的AMR流行率作为治疗切换阈值,以评估其对BRD复发、AMU使用和AMR流行率的影响。

关键结论与观点

  • 在基础生态和治疗条件下,pen-level testing-informed(TI)策略对抗菌药物管理或经济结果无显著影响。
  • 当假设施用AMR流行率较高时,不同抗菌药物类别的使用类型和频率发生变化,但未显著影响耐药性或发病率。
  • 采样时间和检测准确性对AMR检测阳性率和相关输出有显著影响,尤其在极端BRD治疗方案下,即所有病例均使用15元环大环内酯类药物。
  • 模型显示,pen-level采样和检测策略的实施效果高度依赖于BRD治疗方案、AMR流行率、检测准确性及治疗切换阈值。
  • 该研究验证了混合ABM-DES模型在模拟不同干预策略中的灵活性,为未来AMR控制研究提供了方法支持。

研究意义与展望
本研究为pen-level采样和检测在BRD治疗中的应用提供了理论依据,表明在特定条件下,该策略可能减少抗菌药物的不当使用并控制耐药性发展。未来研究可进一步优化检测方法、采样频率和处理延迟,以提高模型的实用性和适用性。此外,该模型可扩展至其他畜牧系统,用于评估不同AMR控制策略的潜在影响,为全球抗菌药物管理提供数据支持和策略建议。

 

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结语
本研究使用混合ABM-DES模型探讨了pen-level采样和检测对抗菌药物选择在BRD治疗中的潜在作用。结果显示,尽管在基础条件下TI策略未显著改善抗菌药物管理或经济结果,但在高AMR流行率或极端治疗方案下,采样和检测策略对抗菌药物使用和耐药性控制具有一定影响。模型验证了采样时间、检测准确性、AMR阈值和治疗方案在实际应用中的复杂关系,强调了这些因素在AMR控制中的关键作用。本研究为未来基于检测的AMR干预策略提供了实验基础和建模支持,有助于优化抗菌药物管理实践,提升畜牧业的可持续性与公共卫生安全。

 

文献来源:
Dana E Ramsay, Wade McDonald, Sheryl P Gow, Nathaniel D Osgood, and Cheryl L Waldner. The Potential for Sample Testing at the Pen Level to Inform Prudent Antimicrobial Selection for Bovine Respiratory Disease Treatment: Investigations Using a Feedlot Simulation Tool. Antibiotics.
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