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重轻链配对评估
抗体序列分析
2025-08-26
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重轻链配对评估
1 简介
AbPair 是一个基于先进AI算法和大量丰富的抗体天然配对序列训练的人工智能工具,用于预测重链和轻链的自然配对分数,能高效评估重轻链的配对潜力,为抗体设计和优化提供科学依据。
模型训练采用Observed Antibody Space1(OAS)数据库非冗余的167万真实配对的人类序列,以及500万人为错误配对的人类序列。测试集指标AUC>0.992,ACC>0.945。输入要求是人类完整的VH 和 VL,否则会影响预测的准确性。
2 表现

Table 1. 模型在测试集上的指标

Figure 1. 模型在测试集上的混淆矩阵图

Figure 2. 模型在测试集上的可靠性曲线图

Figure 3. 模型在测试集上的ROC曲线和精确率-召回率曲线
3 参数说明
- Heavy Chain Sequence:人类重链的完整的Fv序列。
- Light Chain Sequence:人类重链的完整的Fv序列。
4 结果说明
- Score: 重链和轻链的自然配对评分。
5 参考文献
[1] Kovaltsuk, A. et al. Observed Antibody Space: A Resource for Data Mining Next-Generation Sequencing of Antibody Repertoires. The Journal of Immunology 201, 2502–2509. https://doi.org/10.4049/jimmunol.1800708

